-GUI（）是一个网页平台才能交互建立复杂模拟的输入模型，模型可用于、NAMD、、AMBER、、、、和软件。-GUI的开发项目已被广泛用于各类目的，现今包含许多不同的模块，借以Input模块中构建广泛的分子模拟系统。
一、使用说明
1.使用前要先用学术邮箱注册，验证邮箱后直接登陆就可以去建我们想建的模型
2.登入帐号后，依次点击Input-->-->，还会出现右图，网页下拉能够看见/以及Only两个模块。
可以帮助用户生成一系列输入，以建立用于分子动力学模拟的蛋白质/膜复合物。
*注意在notethat下边有三句话：
1.lipidcanbebuiltwithDMPC,DPPC,DOPC,POPC,DLPE,andPOPE.（DMPC、DPPC、DOPC、POPC、DLPE和POPE可产生均质脂类双分子层）
2.alipidcanbebuiltwith434lipid(seelipidlist).（非均相脂类双分子层可以由434种不同的脂类分子组成（看lipidlist））
3.thecanbeusedforalipid(onlyusingthe).（非均质膜建立模块可用于均质脂类双分子层建立）
二、构建非均质膜
1）点击Only，
2）点击NextStep:，还会出现右图所示页面：
出现一行红字：”Lipid”选项不在支持，可以使用”Lipid”来建立Lipid。所以我们直接
3）点击Lipid，出现右图：
*注：
BoxType:长圆形（默认）
多边形（只有、NAMD、支持）
ofZbasedon:
Water水层宽度，默认值22.5，是体系底部和顶部的最小水层高度
水素数细胞膜模型制作，默认值50，是每位脂类分子对应的水份子数
通常选择water的默认值或则更改默认值
ofXYbasedon:
oflipid脂类成份百分比
oflipid脂类成份的数目
ofXandY:NUM(初猜)
（X轴和Y轴的系统规格必须相同）
LipidType脂类类型[e]脂类所带电荷
TailInfo[sn1/sn2]尾信息键盘箭头放起来才会出现脂类的二维图
Ratio()上半层脂类所占比列（具体数量）
()下半层脂类所占比列（具体数量）
Area脂类的表面积
其中Ratio()/()填写比列还是具体脂类分子数取决于3中，我们选定的是oflipid，还是oflipid。
实际建立大肠链球菌细胞膜，磷脂双分子层组成：POPE：POPG：POCL1=75%：25%：5%，选择如右图：
根据比率选择后，点击showtheinfo按键，还会出现右图红框中的内容：
点击网页右下角NextStep:thesize，等待估算过程完成，会出现右图：
通常这页没有错误，就可点击NextStep，之后添加平衡离子，默认是KCL，假如要修改离子类型，须要点击，重新估算修改后离子的数量模拟体系的规格，X、Y、Z个方向，点击NextStep:Buildmodel，等待估算完成得到右图页面：
点击Nextstep:，等待估算过程完成出现右图页面：
点击Nextstep:，等待估算过程完成出现右图页面：
气温可更改view，可以点开看模型，这儿要自己自动选择，选择完成后
点击Nextstep:and，估算完成后出现右图：
点击页面右上角的.tgz，才能下载-GUI建完后的非均质磷脂双分子层模型。
四、解压获取拓扑文件夹
下载完成后细胞膜模型制作，解压后会得到、两个文件夹以及若干文件，文件夹下包含拓扑文件夹以及用于模拟的输入文件以及参数文件。
我们把文件夹复制到Linux系统中，打开文件可以看见#!/bin/csh，该文件是一个cshshell文件，运行命令：chmod+x;csh即可对模型进行动力学模拟。右图红框是更改及添加的内容，根据更改后文件可顺利运行。