生物膜的特定功能主要是由蛋白质完成的；膜蛋白约占膜的40%～50%，有50余种膜蛋白；在不同细胞中膜蛋白的种类及浓度有很大差别。有的浓度不到25%，有的达到75%；通常来说，功能越复杂的膜，其上的蛋白质浓度越多。
膜蛋白是膜功能的主要彰显眷。依据与膜脂的结合形式以及在膜中的位置的不同，膜蛋白分为：整合蛋白（）、外周蛋白（）脂锚定蛋白（1ipid—）。
整合蛋白（）：部份或全部镶嵌在细胞膜中或内外两边的蛋白质；按照跨膜次数将跨膜蛋白分为单次跨膜、多次跨膜、多亚单位跨膜等；整合蛋白约占膜蛋白的70一80%。整合蛋白与膜结合十分紧密，只有用去垢剂（）能够从膜上漂洗出来．常用SDS和—X100。
外周蛋白又称为外在蛋白（），为水溶性的，分布在细胞膜的表面．靠离子键或其他较弱的键与膜表面的蛋白质分子或脂分子的亲水部份结合，因而只要改变碱液的离子硬度甚至提升体温就可以从膜上分离出来。
脂锚定蛋白（Lipid—）：又称脂联接蛋白（1ipid—Iinke（）．同脂的结合有两种形式：一种方法是通过一个甜度子间接同脂单层中的脂结合；一种是蛋白质直接与脂单层中的脂结合。脂锚定蛋白通过磷脂或脂肪酸锚定，共价结合。分两类．一类是糖磷脂酰肌醇（GPl）联接的蛋白，GPl坐落细胞膜的外小叶．用磷脂酶C处理能释放出结合的蛋白。许多细胞表面的受体、酶、细胞黏附分子和导致羊搔痒病的PrPC就是这类蛋白。另一类脂锚定蛋白与插入质膜内小叶的长哦氢链结合。
膜蛋白提取方式
膜蛋白具有许多重要的细胞功能，对生物体存在至关重要。她们具有超过60%的抗生素靶向，占细胞总蛋白的20%-30%。膜蛋白包括完整的膜蛋白，跨膜蛋白和外周膜蛋白。
膜蛋白或则附着在脂类双分子层上或则通过疏水细胞膜蛋白，离子或其他非共价与膜周边的完整蛋白结合。
使用表面活性剂进行质膜蛋白分离提取效率不高，还有可能破坏蛋白质-蛋白质互相作用，改变膜蛋白的拓扑结构。
在一些下游应用中，比如膜蛋白IP，Co-IP，酶检查，质谱剖析实验，使用无表面活性剂的方式分离质膜蛋白远远好过使用表面活性剂的方式。多年来，使用无表面活性剂方式提取质膜蛋白大致可以分为以下三类方式：
A.传统的蔗糖梯度离心（SGU）：传统的蔗糖梯度离心法自上世纪60-70年代开发，至今仍被许多实验室用于质膜蛋白提取，蔗糖梯度离心可以将细胞蛋白分离成不同的组分和高度浓缩的膜蛋白。这些传统的方式须要大量的起始材料，操作过程复杂历时。
B.双水相亲和性分离：此方式的特征是大多数的亲水性聚合物对在水氨水中是不相容的，形成两个共存相，互相平衡。借助这个性质可以分离许多生物分子包括膜蛋白。该方式相对简单，快速，而且所需的起始细胞数相对较高，且产值相对较低。
C.离心管柱法：使用离心管柱分离技术起始材料仅需2*107个细胞，即可将细胞/组织分离为细胞浆，细胞核，细胞器和质膜组分。
离心管柱带有特定孔径和表面性质，当细胞通过离心管柱，细胞膜被断裂分离出完整的细胞核，此后通过差速离心和密度离心分离出质膜蛋白，无需使用超高速离心。可以应用于SDS-PAGE、、ELISA、IP、Co-IP、MS、2-D、酶活性检查等其他应用。
离心管柱法膜蛋白提取操作方式：
1.将离心管柱及接收管套管放置冰上预冷。
2.细胞样品，低速离心（500-600Xg，5分钟）搜集1-50X106个细胞。接转3a步骤。组织样品，接转3b步骤。（贴壁细胞样品建议使用细胞铲刀搜集，尽量不使用胰酶消化）注意：从细胞样品中分离质膜蛋白，建议细胞量为20-50X106个细胞。
3a.用预冷的PBS清洗一次细胞。清除上清，在A中重悬细胞（起始细胞数大于5X106加入200ulA，起始细胞数小于5X106加入500ulA）。冰上孵育5-10分钟。涡旋大力回落10-30秒。迅速将细胞悬液转到离心管柱中。接转步骤4.
3b.组织样品，将新鲜组织（10-30mg）或冷藏组织（20-30mg）放置于离心管柱上。加入200ulA，用塑胶棒反复扭转碾磨组织1分钟（注意：假如你的样品是骨骼或是心肌，建议在碾磨前加入100-200mg组织分离粉）。再加入300ulA，用吸头吹打几次后，开盖冰上孵育5分钟。接转步骤4.
注意：存在少量的非均质组织不会影响样品的质量。塑胶棒可重复使用。用75%酒精擦洗或用分馏水冲洗干净。
4.盖上桶盖，16,000Xg，离心30秒。（此步骤推荐使用可在10S内达到离心力的台式离心机，离心机的离心力和升速时间会影响膜蛋白得率）优化：细胞样品建议第4步完成后再度重悬细胞，转移回离心管柱中，16,000Xg再度离心30秒，重复此步骤可以降低20-30%产值。
5.弃去离心管柱，涡旋大力回落10秒重悬细胞。
6.700Xg，离心1分钟（沉淀是完整的细胞核）。将上清转移到新的1.5ml离心管中，4℃细胞膜蛋白，离心10-30分钟（延长离心时间可以降低产值），弃去上清（上清为胞浆组份），保存沉淀（沉淀为总膜蛋白组份包括细胞器和质膜）。
若果不须要分离质膜做到此步骤即可，产值通常为10-500ug/样品。可将总膜组份储存于-70℃或者按照下游实验选择溶化液溶化。假如须要提取质膜，请不要冷藏总膜组份。分离质膜继续第7步骤。
7.加入200ulB用吸头反复吹打或涡旋回落重悬总膜蛋白组份。4℃，，离心5分钟（注意：假如*终质膜组份中富含细胞器膜污染，此步骤离心时间可降低到20分钟提升含量，次使用建议根据说明书操作，无需调整离心时间）。沉淀部份为细胞器。
8.当心的将滤液转移到新的2.0ml离心管中，加入1.6ml预冷的PBS混匀几次。，离心15-30分钟（延长离心时间可以降低产值）。弃去碱液，保存沉淀（沉淀为质膜蛋白）。产值通常为10-300ug/样品。质膜蛋白可以依据下游实验需求用20-200ul含表面活剂的缓冲液溶化。