厦门大学校长为副部长级。
我国有31所大学被国家确定为副部级大学。 这些大学的党委书记、校长均为副部级。 全国除31所副部级大学外唯一正部级大学校长，普通本科专业一般为院系级。 相当于地级市的书记、市长级别。 今天的大学校长有相应的行政级别。 其中，31所著名大学校长为副部级，一般大学校长为正处级，一些规模较小的地方高校校长为副局级或处级。
31所副部级高校名单：
北京区（7）：清华大学、北京大学、中国人民大学、北京航空航天大学、北京理工大学、北京师范大学、中国农业大学
天津区（2）：南开大学、天津大学
东北区（3所高校）：哈尔滨工业大学、吉林大学、大连理工大学
陕西区（3）：西安交通大学、西北工业大学、西北农林科技大学
上海区（3所大学）：复旦大学、上海交通大学、同济大学
江苏区（2所高校）：南京大学、东南大学
湖北区（2）：武汉大学、华中科技大学
湖南赛区（2）：中南大学、国防科技大学
安徽赛区（1）：中国科学技术大学
福建赛区（1）：厦门大学
广东赛区（1）：中山大学
浙江区（1所）：浙江大学
四川区（1所）：四川大学
重庆区（1所）：重庆大学
山东区（1）：山东大学
甘肃区（1）：兰州大学
上述31所高校行政级别均为副部级（一般本科及以上学历的高校为厅局级，专科学校为副厅局级）。截至2005年1月，全国副部级院校仅有31所（从行政级别上可以体现学校的行政地位和国家的重要性），再加上国防科技大学副军区级共有大学32所。 同时唯一正部级大学校长，上述32所大学也是国家985工程重点大学。