孙昌璞博士，1962年生于广东省新金县(今北镇市)，1984年结业于西南师范学院专科，1987年于该校获得硕士学位，1992年于南开物理研究所获博士学位。1990年和1992年先后破格晋升西南师范学院副院长和院长，1994年担任福建学院博士生导师。1996年，兼任中国科大学理论化学所研究员。从2012年7月起，任中国工程化学研究院深圳估算科学研究中心院长；从2015年5月起，任中国工程化学研究院研究生院教授。2009年11月连任为中国科大学教授，2011年11月被选为发展中国家科大学（原第三世界科大学，TWAS）教授。曾获国家自然科学二等奖、中国科大学青年科学家银奖、国家科委科技进步银奖和中国青年科技奖等奖项，以及全省先进工作者和广东省特等劳动模范等荣誉称号，10次被评为中国科大学“优秀研究生指导班主任”和“优秀导师”。
孙昌璞常年从事量子化学、数学化学及量子信息基础理论研究。已发表学术论文300余篇。其中q-变型玻骰子的工作是该领域国际上三个开创性工作之一中国工程物理研究院在那，获日本ISI“经典引文奖”。该论文荣获法国哈佛学院图书馆《mostcitedin》。英国《科学》1995年特刊介绍中国科学发展，提到了这个工作。基于这个研究，他用代数方式构造了杨-等式新解，由此发展了基于原子载流子波迸发的量子储存方案。他在20世纪80年代末，先后发展了两种量子绝热近似方式的非绝热修正理论。十多年后，人们从实验角度开始关注和应用相关的理论观念，孙昌璞等也由此提出了类似斯特恩-盖拉赫实验分离手征分子的理论方案。在20世纪90年代初，孙昌璞构建了量子检测和量子耗散的因子化模型，由此发觉，具有内部关联的环境出现量子相变时中国工程物理研究院在那，与它耦合的系统的退相干会被明显提高。他于2006年预言的这些量子临界环境的动力学敏感性，在2008年后被美国、加拿大、意大利和中国的5个实验所检验和否认。孙昌璞还提出了与电荷量子比特耦合进行纳米机械振子致冷的主动机制，美国冷却LC介观电路的实验原理与此一致。他与台湾理物理所合作发觉，反演对称性破坏的约瑟夫森多结系统，会发生自然原子电偶极选择定则所禁戒的跃迁，进而产生循环结构的三基态人工原子。美国和加拿大联合实验否认了这些人工原子的存在。他研究了低维纳米结构上单光子的传输和侦测，探求了人工光合作用的化学基础，剖析了空间结构对光捕获复合物LH2中真菌叶绿素(BChl)的迸发能量转移中的影响。文章被推荐为封面文章发表在JCP上。
近些年他主要研究低维结构中光子传输、生命过程中的量子相干效应和复杂系统的可靠性。他积极探求国家需求牵引的基础研究模式创新，并在中物院研新型究生院创建中进行实践。
孙昌璞重视青年人才的培养。他指导的研究生有6人获“中科院优秀博士论文”，2人获全省“百篇优秀博士论文”，1人获2006年中科院教授非常奖和英国Los国家实验室的。