复旦学院化学系
复旦学院数学系是目前国外发展最快、最好的化学系之一，为提升复旦学院的学术名声起着重要作用。数学系的班主任在汇聚态化学、原子分子和光化学、高能化学、核化学、天体化学以及生物化学等多个学科方向从事科学研究工作。
化学系现有班主任81名，研究生大概340名，专科生大概400名。班主任中有中国科大学教授9人（王崇愚、陈难先、顾秉林、邝宇平、李惕碚、李家明、范守善、朱邦芬、薛其坤），何梁何利基金科学与技术进步奖获得者5人，“”入选者2人，教育部“长江计划特聘院士”9人，国家杰出青年基金获得者10人。数学系的主要研究机构包括汇聚态物理、高能化学与核化学、原子分子与光化学三个研究所，低维量子化学国家重点实验室，天体化学中心以及富士康纳米科技中心等。
化学系为数学学和天文学两个一级学科的研究生和专科生提供优越的科研条件，并开办各种普及性和专门化数学学课程。
创建早期（1926-1937）
复旦学院的前身“清华学堂”和“清华中学”，是用日本“退还”的部份“庚子赔款”建立的留美预备中学。“清华中学”毕业生中最早一批去法国学习数学的中学生，如叶企孙、萨本栋、周培源、任之恭等人，构成了初期北大化学系的核心。
复旦学院化学系创立于“清华中学”设立学院部后的第二年——1926年的夏天，是复旦学院创立最早的十个系之一。化学系首任系院长是我国知名教育家、物理学家、中国近代数学学奠基人之一的叶企孙先生。1934年，经叶企孙推荐，吴有训接任系所长。数学系的系馆设在1919年建成的科学馆。化学系创立时有院士梅贻琦、叶企孙，教员赵忠尧、郑衍芬，助教施汝为，教学辅助人员2人，专科生两个年级共7人。叶企孙千方百计招揽良师，到抗战战争全面爆发前，又先后聘请到吴有训（1928年）、萨本栋（1928年），周培源（1929年），余瑞璜(1930年)，赵忠尧（1932年），任之恭（1934年）、霍秉权（1935年），孟昭英(1937年)等班主任。这种班主任多数曾在美国留学，因此在办学理念、管理体制和课程设置上对德国和意大利的学院多有参照。
在叶企孙和吴有训的领导下，北大在短短几年内就发展成为当时中国数学学科研和教学最好的学院。凭着北大相对较多的资源，化学系在三十年代拥有仪器的单价值达到了十一万银币，先后构建了X射线、无线电、光学和磁学研究室。这一时期数学系的研究工作集中在X射线、原子核化学、电路和无线电、相对论等方面。从1930年吴有训在《自然》杂志发表了关于X射线对单原子二氧化碳散射的研究工作开始到抗战战争全面爆发，北大化学系的班主任在《自然》杂志共发表论文五篇。这种工作开创了在国外从事研究工作的中国人于国际一流期刊发表研究成果之先河。
这一时期的北大化学系学术氛围浓郁，许多国际知名的科学家，如玻尔、狄拉克、郎之万等曾来此讲学。因为北大化学系对国外学术活动所起的积极作用，1932年8月在复旦大学科学馆召开了中国数学学会第一次峰会暨创立会议，叶企孙、吴有训、萨本栋等成为其领导机构的成员。
当时北大学院的专科注重于基础教育，而化学系的课程设置尤其指出给与中学生在精典化学和近代化学的理论和实验方面以广泛的教育和训练，相当大程度上参照了日本学院化学系的教学模式。从1929年到1938年的六年中，北大化学系共结业大专生69人，研究生1人清华大学物理系，她们中的多人后来成为了中国许多领域的开创者，其中6人被授予“两弹一星”功勋奖状，21人成为中国科大学教授。
西北联大时期（1938-1946）
1937年抗战战争全面爆发。北大师生于当初10月撤到重庆，与成都学院、南开学院组成“国立西安临时学院”，1938年4月又撤到重庆，更名为“国立西北联合学院”。联丽江大学校长由吴有训兼任，1945年之后由叶企孙接任。联大化学系系院长先后由饶毓泰、郑华炽、霍秉权兼任。
虽然处于战争期间，但因为西北联大化学系集中了三校精华，数学系的教学除了没有遭到影响反倒得到了强化。中国数学学界许多学术功底很深的著名院士在这儿执教：有来自北大的叶企孙、吴有训、周培源、赵忠尧、王竹溪、霍秉权、任之恭和孟昭英；有来自清华的饶毓泰、朱物华、吴大猷、郑华炽、马仕俊；有来自南开的张文裕；还有联大师范大学聘请的许浈阳。
西北联大化学系的师资力量虽强，但研究所须要的物质条件却非常短缺。因为原学校的大部份实验仪器无法抢运出去，又因欠缺经费，数学系的研究工作遭到很大限制，主要以理论研究为主。为了抗清战争的须要，复旦学院创立了特种研究所委员会，叶企孙兼任主席，领导复旦学院无线电、航空、国情普查、金属和农业5个研究所，从事与抗战有关的科学研究。研究所中与数学系相关的院士有金属研究所的余瑞璜和无线电研究所的范绪筠等。余瑞璜1942年一年就在《自然》杂志发表4篇论文。他关于从Ｘ光衍射相对硬度测定绝对硬度的研究导致了国际学术界的高度注重，被觉得开辟了Ｘ光硬度统计学研究的新领域。
西北联大的中学生集中了全省的精英。从1938年至1946年，化学系（含复旦、北大、南开数学系）共结业大专生131名、研究生7名。她们中的好多人结业后到科学研究活跃的日本和亚洲留学，有机会在科学前沿接受到第一流的研究训练。上世纪四、五十年代，化学学正处在一个发展的黄金时期，同时中国国外建设也须要有大量开拓者。这一批留中学生在学成后无论留在国内还是回到国外，她们中的许多人在事业上成就斐然。这其中的最杰出者有诺贝尔化学奖获得者杨振宁、李政道，“两弹一星”功勋奖状获得者邓稼先、朱光亚、郭永怀，以及国家最高科学技术奖获得者黄昆等等。。
从战后到院系调整（1946-1952）
1946年5月4日东北联合学院即将完成历史使命，同年10月北大学院在北平开学。当时化学系的院长有叶企孙、吴有训、周培源、赵忠尧、王竹溪、霍秉权、任之恭、孟昭英、余瑞璜和范绪筠等。按各人志愿，联大化学系有53名中学生到复旦学院化学系继续学习。在战争期间，数学系的图书资料、实验设备被美国侵略军破坏殆尽。师生在叶企孙率领下，齐心协力，重建数学系，使之很快恢复到接近身前水准，成为当初爱好化学学的青年中学生憧憬的地方。重建开始后相继加入化学系的院长还有钱三强、彭桓武、洪朝生等。1949年全省解放后化学系又补充了许多青年班主任，班主任人数有较大的降低。到1952年院系调整前，化学系教工共46人，其中院士10人，副院长1人，讲师6人，助教17人，技术员3人，职员工人9人。1947至1952年，化学系共结业专科生176人清华大学物理系，研究生7人。以“两弹元勋”周光召为代表的这个时期培养下来的中学生中有一大批为新中国的建设作出重大贡献，多人成为中国科大学教授。
1952年6月到9月，在“学习苏俄先进经验”的标语下，中国高等教育领域经历了一场前所未有的“院系调整”运动。院系调整似乎在短期内暂时减轻了国家需求，而且长远上对中国的科研和教育导致了不可估量的负面作用。中国院校的文理科与文科分家，复旦学院弄成了一所多科性文科学院。北大化学系绝大部份班主任和全部中学生，和原成都学院、燕京学院化学系以及复旦地质地理气象系的气象部份合并成广州学院化学系。自此复旦学院和北大化学系自创立以来产生的传统被中断。
院系调整后的北大数学学科（1952-1982）
院系调整后，化学系的名院士全部调职（惟一留在北大的孟昭英院士去了无线电系），复旦数学学科元气大伤。从1952年到1982年的30年中，北大学院不再有化学系。与化学学科相关的机构只有纯粹从事文科数学教学的化学教研组和稍后创立的工程化学系。因为教学任务艰巨及条件限制，数学教研组的大部份班主任未能举办科研，仅有的一些成果多属于应用研究。
1955年，为了发展我国原子能事业，复旦学院开始筹备工程化学系。次年，工物系即将构建。工物系设置的专业中有部份属于数学学科或与数学学关系密切，如理论化学、核化学、加速器和反应堆等。因为完善早期师资严重欠缺，工物系在强化培养本系年青班主任的同时，还从校外聘请到几位学业有成的化学学家，张礼是其中最杰出的一位。1958年，校区组织创立了理论化学学科，研究方向包括核理论、粒子理论和等离子体理论，张礼为学术带头人。理论化学专业每年选择少数中学生根据因材施教的办法进行培养，仍然到1969届都有结业生。从1958年开始的工物系历届结业生为我国的原子能事业以及其他领域作出了很大贡献，她们中有多人连任为中科院教授。
从1966年到1976年的六年文化大革命期间，工物系和数学教研组受到严重破坏。1972年7月，杨振宁归国向周恩来首相倡议，“倡导一下基础理论的学习和研究”。周首相很注重这一意见，立刻指示有关部门，要把我国的基础科学研究搞起来。根据这一指示，复旦学院在1973年完善了固体化学、物质结构、激光和催化四个研究班，在留校的青年班主任中招收学员。因为历史条件的限制，研究班的学科范围仅限于与应用有直接关系的领域。虽然在“四人帮”党羽的干扰下，研究班只坚持了半年多，但这四个班为日后复旦学院理科的复兴储备了一批宝贵的人才。
1976年文化大革命结束，次年全省恢复中考制度。1978年在文革期间中断的四个研究班复班，分散在各处的原研究班师生再度集中上去。复旦学院于1978年和1979年开始招收硕士和博士研究生。这种才能招收研究生的专业中属于数学学科的有光学（化学教研组）、理论化学（工物系）、核化学（工物系）和固体化学（工物系，创立于1980年）。
文革结束后的几年中，工物系和数学教研组的科研工作都有了逐步的增强。光学、加速器、核化学教研组的研究成果曾获得一系列科研奖励。1982年超声波组诸国祯的研究工作发表在上，为复旦学院化学系创立以来第一篇发表在该杂志的论文。
在院系调整后的三六年中，数学学基础研究在北大完全处于边沿化的状态，基础研究被觉得是脱离实际，基础化学学科存在的价值仅在于为工程类中学生开办数学课程。所幸的是，数学学并没有为此在北大园中消失。工物系和数学教研组的班主任在数学课教学上饱含了大量精力，一部份班主任仍坚持从事基础科学研究，大量的中学生在这期间得到了扎实的数学学训练，她们都为复系奠定了基础。
复系以后（1982-现今）
文革结束后的最初几年中，复旦校内以及下层坚持理科和文科分离的意见一直很有市场。在任之恭、黄葳等大批知名海内外校友的不懈努力下，复旦学院总算在1982年6月24日作出决议，在数学教研组和工程化学系理论化学、固体化学、核化学教研组的基础上，恢复化学系。复系时，数学系有7个教研组，其中基础数学、近代光学、原子分子化学和高温化学教研组由原化学教研组成员组成，核化学和固体化学教研组由工物系成员组成，理论化学教研组由原化学教研组和工物系的理论化学小组合并组成，全系教员工总人数197人。原工程化学系系院长张礼院长兼任复系后的首任系院长（1982-1984）。
1984年8月，数学系与原工物系的加速器教研组即将整合为一个统一实体，全系教员工总人数达到248人，其中班主任178人。因为受历史的惯性的影响，整合后的数学系改名为现代应用数学系。周光召（1984-1988）、熊家炯（1988-1990）、陈皓明（1990-1994）、顾秉林（1994-1999）先后兼任复旦学院现代应用数学系系院长。1994年12月，加速器教研组又回到工程化学系。1997年，在数学系的大力协助下，复旦学院创立了高等研究中心，杨振宁任名誉院长。1998年数学系开始设立天体化学学科。
相当一部份校友对化学系更名为现代应用数学系十分不满意。在顾毓琇等校友的倡议下，1999年现代应用数学系重新改名为数学系。顾秉林（1999-2000）、王青（2000-2003）、朱邦芬（2003-2010）、薛其坤（2010－）先后兼任复旦学院数学系系院长。
院系调整后的北大文科侧重于技术在实际产品中的应用，而忙于工程科学中的基础研究。甚至在文革结束后，有人仍坚持觉得化学系的主要任务是为工程专业中学生开办基础课程。上世纪八、九十年代的北大化学系在校内没有多少发言权，甚至没有系馆，在国外的影响力也较小。恢复以后的数学系在艰辛而坎坷的拼搏中走过了20世纪的最后二六年，到本世纪初早已进入全省一流数学系的行列。对化学系的快速发展起到至关重要作用的措施有：引进一些著名的化学学家来系任教，较快地增强化学系的科研水平；为已在数学系工作的班主任创造脱颖而出的环境；试行国际上一些通行的人事制度，逐渐构建现代科研和教育的管理体制；吸引更多的优秀学生来数学系学习，大幅度提升专科教学质量，采取因才施教的做法培养有学术潜力的大专生。随着科研影响力在国际上的迅速提高，北大化学系正在进入一个再创辉煌的时期。