2010年7月22日至26日，首届中国大学生生物物理竞赛在南开大学举行，南开大学、南京大学、浙江大学等12所高校参赛2012初中全国物理竞赛，多所高校派代表参赛。教育部高等教育司司长张大良、南开大学党委书记薛锦文出席开幕式并致辞，中国科学院院士、陈省身数学研究所副所长、理论物理实验室主任葛墨林为获奖选手颁奖。
2011年8月15日至20日，第二届中国高校生物物理学科竞赛在南京大学举行，来自南京大学、北京大学、清华大学、南开大学、上海交通大学、浙江大学、中国科学技术大学等23所高校参加了本次竞赛。与首届竞赛相比2012初中全国物理竞赛，本次竞赛增加了决赛环节。南京大学副校长谭哲民教授致欢迎辞并宣布竞赛开幕。
2012年8月18日至23日，第三届中国大学生生物物理竞赛在北京师范大学举行，来自全国35所高校的36支队伍参赛。本次竞赛进入决赛，北京大学荣获冠军。教育部高等教育司理工司李茂国、北京师范大学副校长陈光举出席开幕式。
2013年8月12日至17日，第四届中国大学生生物物理竞赛在兰州大学举行，来自全国38所高校的39支队伍参赛。最终，南开大学、北京大学、哈尔滨工业大学三所高校夺得冠军，首轮比赛总分排名前三的队伍进入决赛。此外，北京师范大学在五轮预赛中均取得最高分，以第四名的成绩进入决赛。关于中国大学生生物物理学术竞赛的历史，中国科学院院士吴岳良作了题为《物理学的主旋律与挑战》的学术报告。
2014年8月19日至23日，第五届中国大学生生物物理竞赛在华中科技大学举行，来自全国38所高校的39支队伍参赛。最终，南开大学、北京大学、南京大学夺得冠军，第一轮比赛总成绩排名前三的队伍进入决赛。此外，哈尔滨工业大学因在五轮初赛中均取得最高分，以第四名的成绩进入决赛，哈尔滨工业大学代表队利用光的反射原理，得到全息立体图案网校头条，获得评委的一致好评，荣获本次比赛冠军。中国科学院院士、华中科技大学副校长罗俊出席开幕式并致辞。值得一提的是，参加本次大赛的中国电子科技大学物理与电子学院本科生任瑞龙、陆群峰对本届大赛主题之一《巧克力液固相变中的滞后现象》进行了深入的跟踪研究，其教学研究论文《巧克力相变中的滞后现象》成功入选2016年度著名SCI教学期刊《欧洲物理杂志》。
2015年8月19日至24日，第六届中国大学生生物物理竞赛在国防科技大学举行，来自全国48所高校的49支队伍参赛，约600名师生参赛，共设置81个比赛项目，国内21所高校的师生观摩了本次比赛。最终，中国科学技术大学、南京大学、南开大学、浙江大学、哈尔滨工业大学进入决赛，哈尔滨工业大学成功卫冕，成为CUPT历史上首支实现卫冕的高校队伍。
2016年8月13日至18日，第七届中国大学生物理竞赛在西安交通大学举行，来自全国64所高校的65支队伍参赛，另外16所高校的师生观摩了比赛。比赛在哈尔滨工业大学、南开大学、浙江大学举行，南开大学获得冠军。西安交通大学副校长郑庆华、西安交通大学理学院党委书记郑元锁、工程车间主任王静出席开幕式。西安交通大学党委常务副书记王小莉、教育部本科生物学课程教学指导委员会副主任陈强等嘉宾出席闭幕式并为获奖选手和团队颁奖。
第八届中国大学生物理竞赛于2017年8月13日至18日在哈尔滨工业大学举行。本次竞赛共有来自全国74所高校的75支队伍参赛，其他高校也有26支队伍参赛。全校师生观摩了本次竞赛，参赛高校达100余所。本次竞赛由黑龙江省物理学会、哈尔滨工业大学物理系联合主办，黑龙江省科学技术协会、哈尔滨工业大学本科生学院支持。南开大学、哈尔滨工业大学、西安交通大学进入本次全国大赛决赛，哈尔滨工业大学最终夺得冠军。闭幕式上，2004年诺贝尔物理学奖获得者、美国加州大学圣芭芭拉分校教授、美国物理学会现任会长戴维·格罗斯为全国高校师生作了题为《我的物理学生涯——从夸克到弦》的精彩演讲，并为在比赛中获得个人奖项的学生颁发了荣誉证书和奖品。值得一提的是，在同期播出的中央电视台大型科普娱乐节目《加油！奔向未来》中出现的节拍器耦合实验，正是本届CUPT的竞赛题目之一。
第九届中国大学生生物物理竞赛将于2018年8月在山西大学举办。据悉，由于大赛规模和影响力不断扩大，CUPT从下届比赛开始将引入地区赛。全国赛规模控制在60支队伍，上届比赛排名前50%的高校将直接进入下届全国赛，其余队伍将通过华北、东北、华东、中南、西南、西北6个地区赛选拔，每个地区可推荐4所高校，主办方将根据高校自身条件择优选择1-2支队伍参赛。