准确的说应该是“两朵乌云”。其出处为：
在19世纪末，经典物理学(包括力学、声学、热学、光学、电磁学等)已经趋于完善，在各个领域都取得了令人欣喜的成就。
在1900年，著名英国物理学家开尔文(威廉·汤姆逊)在一篇瞻望二十世纪物理学的文章中他先说：“在已经基本建成的物理学大厦中，后辈物理学家只要做一些零碎的修补工作就行了……”，接着他又说：“但是，在物理学晴朗的天空的远处，还有两朵小小的令人不安的乌云”。
这两朵小小的“乌云”，是令当时的物理学家不安，因为经典物理学无法解释它们。
其中一朵乌云是指：迈克耳逊－莫雷实验
电磁场理论建立后，人们知道电磁波在真空中的传播速度等于光速c，认为光也是电磁波。当时的科学家根据经典力学的波动理论认为，电磁波的传播应该依赖于某种介质，当时又找不到是什么介质，所以就认为这种介质一定存在，它应该是看不见，又摸不着，弹性应该很好，并称之为“以太”，光速c应该是相对以太而言的。
这样一来，如果以太和地球有相对运动，那么在地球上测量出来的光速就有可能小于c或大于c.为了观测“以太风”是否存在，迈克耳逊与莫雷合作进行了一个著名的“迈克耳逊－莫雷实验”，但实验结果是:以太与地球没有相对运动——即“以太零漂移”。使科学家处于左右为难的境地，要么以太不存在，要么以太总与地球一起运动（相对静止）。若以太不存在，电磁波靠什么传播？经典物理学无能为力了。这就是开尔文所指的第一朵“乌云”。
其中另一朵乌云是指：热辐射实验
物理学家解释黑体辐射实验的结果时，认为能量是一种连续变化的物理量，在低频部分和经典物理学的理论结果与实验事实比较符合，但是高频区（紫外光区）理论结果和实验数据相差十万八千里，是根本不可能的。这说明经典物理学在解释黑体辐射时，在高频区出现了错误或失败。这是经典物理学的“灾难”，被称为“紫外灾难”。这就是开尔文所指的第二朵“乌云”。
这两朵小小的乌云，后来引发了物理学中的一场革命风暴。
上述两个问题的解决导致了全新观念的物理理论的诞生。对前者的进一步研究，爱因斯坦建立了相对论；对后者的深入研究，建立了量子论（量子力学）。
